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Laboratoires académiques participants
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Last Update 2009/4/3 16:13
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Laboratoires académiques participants
Promote université d'orléans
Zip code 45067
Promote université d'orléans
Zip code 45067
| Address rue de chartres ORLEANS France |
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DescriptionLes axes de recherche développés au sein de l'Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA) sont orientés vers la conception, la synthèse et l'analyse de molécules susceptibles de présenter une activité dans le domaine des sciences du vivant.
Le laboratoire est une unité mixte de recherche (UMR 6005) sous la tutelle de l'Université d'Orléans et du CNRS. Il accueille une quarantaine de permanents et en moyenne 70 non permanents. La chémoinformatique concerne une équipe de 7 personnes dont trois permanents.
Contact : Luc Morin-Allory : luc.morin-allory@univ-orleans.fr
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Last Update 2009/6/11 19:09
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Laboratoires académiques participants
Zip code 75205
Zip code 75205
| Address 35 rue Hélène Brion Paris France |
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DescriptionLe projet « Recherche de Molécules à visée Thérapeutique par approches in silico » ou MTi est centré sur:
* le développement de nouveaux algorithmes et méthodologies - logiciels de bioinformatique structurale et de chémoinformatique.
* l'identification de petites molécules chimiques actives sur une cible par criblage in silico.
* la caractérisation bioinformatique de nouvelles cibles thérapeutiques.
* la mise à disposition de logiciels dans ces disciplines.
* MTi est associée à deux plateformes IBiSA: RPBS (bioinformatique structurale) et cDithem (drug discovery).
Notre laboratoire (25 personnes) est localise sur le campus de Paris Diderot.
Contact: Bruno O. Villoutreix
Last Update 2009/6/20 14:56
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Laboratoires académiques participants
| Address Institut Le Bel 4 rue Blaise Pascal Strasbourg France |
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Description-Computer-aided design of new compounds;
-Fragment descriptors in data analysis, structure-property modeling and preparation of combinatorial libraries;
-Development of software tools for "in silico" design and data analysis;
- Similarity search for compounds and chemical reactions;
- Management systems for chemical databases. Database development on solvent extraction of metals;
- Propertie assessment (aqueous solubility, liquid/liquid partition coefficient, biological activities, etc);
- Early ADMETox prediction.
Last Update 2009/6/29 16:30
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Laboratoires académiques participants
Promote petitjean CEA/DSV/iBiTec-S/SB2SM (CNRS URA 2096)
Zip code 91191
Telephone Number 01 6908 4006
Facsimile Number 01 6908 4007
Promote petitjean CEA/DSV/iBiTec-S/SB2SM (CNRS URA 2096)
Zip code 91191
| Address CEN Saclay, Bat. 528 Gif-sur-Yvette Cedex France |
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Description
The P450 team is part of a CNRS/CEA research unit located in Saclay:
http://www-dsv.cea.fr/ibitecs/1
Our activities in chemoinformatics and structural biology are mainly:
- Geometric modeling of channels inside various enzymes of the cytochromes P450 family
- Generating 3D databases of small molecules for virtual screening purposes, particularly to predict in-silico potential P450 substrates (or non substrates)
- Handling the flexibility of small molecules by generating a computed number of representative conformers
We develop our own freewares with house-made f77 libraries:
http://petitjeanmichel.free.fr/itoweb.petitjean.freeware.html
The P450 team is part of a CNRS/CEA research unit located in Saclay:
http://www-dsv.cea.fr/ibitecs/1
Our activities in chemoinformatics and structural biology are mainly:
- Geometric modeling of channels inside various enzymes of the cytochromes P450 family
- Generating 3D databases of small molecules for virtual screening purposes, particularly to predict in-silico potential P450 substrates (or non substrates)
- Handling the flexibility of small molecules by generating a computed number of representative conformers
We develop our own freewares with house-made f77 libraries:
http://petitjeanmichel.free.fr/itoweb.petitjean.freeware.html
Last Update 2009/9/26 17:39
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Laboratoires académiques participants
Promote Email
Zip code 77300
Telephone Number +33 1 6469 4782
Facsimile Number +33 1 6469 4705
Promote Email
Zip code 77300
| Address 35 rue Saint-Honoré Fontainebleau France |
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DescriptionLe Centre de Bio-informatique est l'un des 15 laboratoires de Mines ParisTech. Depuis 2008, nous sommes également l'une des équipes de l'unité mixte commune à Mines ParisTech, l'Institut Curie et l'INSERM U900 dédiée à l'épidémiologie, la bio-informatique et la biologie systémique du cancer.
Notre recherche vise au développement de méthodes mathématiques et d'algorithmes pour l'ère de la post-génomique. Nous utilisons en particulier des modèles probabilistes et des méthodes d'apprentissage statistique pour traiter et analyser les données produites par les technologies à haut débit.
Notre but, sur le long terme, est de parvenir à comprendre, simuler et prédire des phénomènes biologiques, et de contribuer au développement de nouvelles thérapies, en particulier contre le cancer.
Compétences-clés en chemoinformatique:
- docking / structure-based virtual screening
- apprentissage statistique pour les approches ligand-based
- apprentissage statistique pour la chémogénomique
Contact: jean-philippe.vert@mines-paristech.fr
Last Update 2009/10/19 17:37
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Laboratoires académiques participants
Promote Didier Rognan CNRS - Université de Strasbourg
Zip code 67400
Telephone Number 03.90.24.42.35
Facsimile Number 03.90.24.43.10
Promote Didier Rognan CNRS - Université de Strasbourg
Zip code 67400
| Address 74, route du Rhin ILLKIRCH France |
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DescriptionLe laboratoire de Chémogénomique Structurale a pour mission de rationaliser et d'accélérer la conception de molécules bioactives. Pour ce faire, nous utilisons une approche chémogénomique se basant à la fois sur la connaissance de l'espace biologique (cibles) et de l'espace chimique (ligands). Notre activité se subdivise en trois parties:
- Développement et actualisation de bases de données moléculaires (cibles, sites actifs, ligands)
- Développement de nouveaux logiciels (ex: IFP, SiteAlign, GPCRmod)
- Application à des cas concrets de drug design.
Nos collaborations sont partagées entre le monde académique et le secteur privé,allant de la petite biotech jusqu'à la multinationale pharmaceutique.
Venez visiter notre site web (http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr) pour plus d'informations.
Contact: Dr. Didier ROGNAN (rognan@unistra.fr)
Last Update 2009/12/30 18:43
Category
Laboratoires académiques participants
Promote Nuzillard University of Reims / CNRS
Zip code 51100
Telephone Number 33 (0)3 26 91 82 10
Facsimile Number 33 (0)3 26 91 35 96
Promote Nuzillard University of Reims / CNRS
Zip code 51100
| Address Moulin de la Housse Faculté des Sciences Exactes et Naturelles Reims France |
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DescriptionAu sein de l'Institut de Chimie Moléculaire de Reims, le groupe "Isolement et Structure" effectue des recherches en chimie des Substances Naturelles pour la découverte de molécules biologiquement actives issues de plantes. Le groupe développe des nouvelles méthodes d'identification structurale par RMN.
Le groupe développe et diffuse un logiciel (LSD, Logic for Structure Determination) destiné à proposer automatiquement des structures moléculaires à partir des données de corrélation des déplacement chimiques issues de la RMN
(http://www.univ-reims.fr).
Last Update 2010/1/26 11:49
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Laboratoires académiques participants
Promote CERMN
Zip code 14032
Telephone Number 0231566820
Facsimile Number 0231566803
Promote CERMN
Zip code 14032
| Address Boulevard Becquerel Caen France |
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DescriptionL'activité du laboratoire, en modélisation moléculaire, est centrée sur deux thématiques :
- Conception de nouveaux ligands dans le domaine des neurosciences et de la cancérologie. Cette conception s'appuie sur la définition de pharmacophores (ligand-based drug design), l'analyse des interactions ligand-récepteur (structure-based drug design) et l'exploitation des chimiothèques. Notre laboratoire possède actuellement une chimiothèque de plus de 12000 composés.
- Evaluation de l'impact des produits chimiques sur l'environnement et la santé humaine. Cette évaluation est réalisée à travers des techniques (Q)SAR et chemoinformatique en collaboration avec le GREYC (CNRS UMR 6072).
Le laboratoire acceuille une trentaine de permanents. L'équipe de modélisation moléculaire comprend 5 permanents.
Contact : Pr R. Bureau : ronan.bureau@unicaen.fr